Fatih, Yenibahçe’de Akşemseddin Caddesi üzerinde bulunan Mimar Sinan Mescidi, “Mimarbaşı Sinan Ağa” olarak da anılır ve günümüzde aynı adı taşıyan bir oyun parkı ile evler arasında kalmıştır. Üzerinde tarih kitabesi bulunmamakla birlikte, vakfiyesinin Kanuni Sultan Süleyman’ın vefatından sonra tescillenmiş olması, yapının daha önce yapıldığını göstermektedir. Osmanlı dönemi kaynaklarında, Evliya Çelebi dâhil, ismi geçen mescid, 1918’de yaşanan yangında büyük zarar görmüş, yalnızca minaresi ve duvarları ayakta kalmıştır. Yangın sonrası etrafına yapılan gecekondular, zamanla beton evlere dönüşmüştür. 1976 yılında Vakıflar İdaresi tarafından yapılan restorasyonla mescid yeniden ibadete açılmıştır.

 Mescidin planı, Mimar Sinan’ın yazlık ve kışlık mektep planından esinlenerek hazırlanmıştır. Ön kısmında açık ve avlu ile çevrili yazlık bölüm yer almakta olup, mihrabıyla beraber geniş bir son cemaat yeri işlevi görmektedir. Arkada ise tamamen kapalı kışlık ibadet mekanı bulunur. Mihrap, alçı vitray süslemeleriyle çevrilmiş olup, duvarlarda yeşil, kırmızı ve siyah tonlarında bitkisel motifler dikkat çeker. Minare, yapının solunda, sekiz köşeli taş biçiminde ve baca görünümünde yükselir. Bu minare, klasik Osmanlı minarelerinden farklı, Sinan’ın özgün tasarım anlayışını yansıtan nadir örneklerdendir.