Kocamustafapaşa’da, Manastır ya da halk arasında bilinen adıyla Esekapısı Mescidi, aslında küçük bir Bizans kilisesinin kalıntısı olarak tarih sahnesine çıkar. XIV. yüzyıl başlarında inşa edilmiş olan bu yapı, zaman içinde harabe haline gelmiş ve 1560 civarında Hadım İbrahim Paşa’nın himmetiyle, Osmanlı dönemi mimarı Sinan tarafından camiye dönüştürülmüştür. Sinan, mescidin orijinal kilise aksını 90 derece döndürmüş, mihrap duvarını güney cepheye almış ve yapıya cami kimliğini vermiştir. Böylece hem Bizans izleri hem Osmanlı mimarisinin zarafeti bir araya gelmiştir.

 Mescidin yapısı, tek nefli uzun ve dikdörtgen planlıdır. Kuzey yan apsisin üzerine oturtulan kısa gövdeli minare, minarenin özgünlüğüne işaret ederken, 1509 ve 1648 depremlerinde aldığı zararlar sonucu bazı kısımları yıkılmıştır. 1894 zelzelesinde ise yapının iki duvarı tamamen yıkılmış, minaresinin şerefe üstü kısmı devrilmiştir. Uzun yıllar ibadete açık kalmış, ancak 20. yüzyıl başlarında büyük tahribata uğramış, medrese ise daha kötü durumda fakir ailelerin yerleşimine sahne olmuştur. Son yıllarda Cerrahpaşa Hastanesi çevresinde yapılan düzenlemelerle çevresi temizlenmiş, ancak mescidin aslına uygun korunması bir türlü gerçekleştirilememiştir.