Kapıağası Mescidi, Eyüp Nişanca’da, Şeyh Murad Tekkesi yakınında, Davut Ağa Caddesi üzerindedir. Mescit, Mimar Sinan tarafından 1555 yılında Babüssaâde Ağası Davud Ağa adına inşa edilmiştir. Yapı yığma taştan yapılmış olup, kıble yönündeki sol köşesi eğimli arazi nedeniyle taş bir payandayla desteklenmiştir. Ahşap çatısı kiremit kaplıdır. Son cemaat yeri de ahşaptır ve içinde küçük bir mihrabçık bulunur. Camiye giriş kapısının üstünde üç satırlık orijinal kitabe yer almaktadır.

   Minare caminin sağında yer alır, taştan yapılmış olup kurşun kaplı bir külaha sahiptir. Minarenin önünde, mescidi yaptıran Davud Ağa’nın sade bir mezarı vardır. Mezar taşında 962 (1555) tarihi yazılıdır, yani caminin yapıldığı yıl vefat etmiştir. Cami, Mimar Sinan’ın eserleri arasında yer almakta olup, "Tezkiretü’l-Ebniye"de adı geçmektedir.

     Mescidin haziresinde 19. ve 20. yüzyıldan birçok önemli isim gömülüdür. Bunlar arasında zâkirbaşı Mehmed Efendi, Hacı Tahsin Efendi ve bazı devlet görevlileri yer alır. Özellikle Mehmed Efendi, dönemin önemli musikişinaslarından olup birçok ilahi bestelemiş ve Cerrahiyye tarikatına mensup olmuştur.